甄嬛传中皇上要除华妃的原因有2点，一、华妃陷害沈眉庄假孕争宠。刚进宫时，眉庄因为家世的加成最先得到皇上的宠爱，因此一时风光无两，可是这宠爱招致了华妃的嫉妒，华妃见不得有人比她更得宠，因此设计一局联合众人毁掉了皇上对沈眉庄的信任。眉庄经由此事染上了时疫，所幸甄嬛并未放弃对此事的调查，最后指出此事是华妃的构陷。皇上并未想到华妃性格如此阴毒，在他心中，华妃只是有点嚣张跋扈，可是经由此事他不得不改变自己对华妃的看法，而且虽然自己知道了此事的经过，可是自己宠爱的沈眉庄却因为此事和自己渐行渐远，皇上心里自然对华妃是十分失望的。

华妃的哥哥年羹尧功高盖主、对皇上多有不尊重。年羹尧是跟着皇上从潜邸时就出来的，可是年羹尧并未珍惜和皇上的君臣之情，他只顾着加固自己的权力王国，不停要求皇上给予封赏，可是功高盖主并不是什么好事，他没有意识到皇上此时已经对他存在许多不满了。而年羹尧的猖狂也毁了自己的前程，在前朝多个大臣联合弹劾之下，年羹尧被杀，华妃失去了倚仗，这也为华妃被杀添了一把火。年羹尧死后，皇上念着和华妃的旧情本不欲杀她，可是华妃自己作死，她指使手下人放火烧甄嬛。况且甄嬛还有一个孩子是被华妃害死的，新仇旧恨一起算，为了安慰甄嬛，皇上也不得不杀死华妃。