顺治不喜欢佟妃的原因有3个，分别如下：

一、顺治的恋爱观，对女人顺治最看重的便是灵魂的自由，简单来说就是女方要有个性和他有共同语言，而佟妃则是一个天真、听话、温顺的女孩，在家时便听从父母的话，在宫中更是顺顺从从，对于这样一个没有个性的女人，自诩要灵魂恋爱的顺治当然不会喜欢。

二、佟妃的家族，顺治一生最想做的事就是自己完全的掌控朝政，然而现实是权利还是在太后和大臣们手上，所以他有逆反心理只要是你们所喜欢的，他就一定会去反着干，再加上佟妃背后的家族势力，显然是冲着皇位来的，这就注定佟妃即使内心单纯，皇上也不会单纯的看待她。所以，他对待这个家族有时表现出的厌恶，就会反馈到这个他身边最近的这个人身上。

三、表立场，当时的太后因为玄烨是站在佟妃这边的，出于逆反心理，他自然会与其反着干，再加上福临太爱乌云珠，急于表明自己的立场，爱屋及乌对乌云珠的孩子肯定更为喜爱，他怕后宫中乌云珠和孩子被欺负。所以在那种佟妃、太后、乌云珠都在场的情况下，急于向太后和乌云珠表明自己态度的时候，佟妃就成了最好的宣泄点。