工藤新一之所以不愿小兰知道身份主要是因为以下三个原因：

一．就像官方解释的一样工藤新一并不想吧小兰拖入危险之中。并不过这个解释在之后似乎并不能站住脚，毕竟那么多人都知道了柯南的真实身份，还不是照样活得好好的吗？而且后面的剧情中看，琴酒根本就不记得工藤新一这号人物，即便告诉了小兰，小兰也不会傻到四处去宣扬吧，所以这个理由只是算是一小部分原因。、

二．柯南和小兰有过太多次的亲密接触了，一开始柯南几次被小兰怀疑，柯南差点就全盘托出，但是关键时刻总有队友帮他隐瞒，所以才一次次打消柯南说实话的念头，也正是这样才让柯南一次次与小兰有亲密接触，不管是睡同一张床，还是和小兰一起洗澡等等 ，要是被小兰知道柯南就是新一，那么柯南大概会被吊起来打。

这点也是最主要的原因，新一太了解小兰了，如果这件事被她知道她可能会豁出性命去帮他，因为她就这种性格的人。关于小兰的这个性格在动漫中表现的十分明显，最明显的一次就是有一次苦艾酒知道了灰原的身份当时的小兰可是冒着枪击的危险救了灰原哀。